يتم تنقية العديد من المركبات عن طريق التبلور من محلول مائي. تستثني البلورة العديد من الملوثات ، ومع ذلك ، يمكن أن يتناسب الماء داخل الشبكة البلورية دون الارتباط الكيميائي بكاتيون المركب. يمكن أن يؤدي تطبيق الحرارة إلى إبعاد هذه المياه ، لكن العملية عادة ما تضر بالبنية البلورية. هذا جيد ، إذا كان الهدف هو الحصول على مركب نقي. قد يكون من غير المرغوب فيه عند نمو البلورات لأغراض علم البلورات أو لأغراض أخرى.
في بعض الأحيان يتم الجمع بين الشكلين. على سبيل المثال ، [Cu (H2س)4]وبالتالي4· ح2يمكن استخدام O لوصف ماء تبلور كبريتات النحاس (II).
الماء عبارة عن جزيء قطبي صغير يتم دمجه بسهولة في المشابك البلورية ، ولكنه ليس المذيب الوحيد الموجود في البلورات. في الواقع ، تبقى معظم المذيبات ، إلى حد أكبر أو أقل ، في البلورة. البنزين هو مثال شائع. من أجل تقليل تأثير المذيب إلى أدنى حد ، يحاول الكيميائيون عادةً إزالة أكبر قدر ممكن باستخدام الاستخراج الفراغي وقد يقومون بتسخين عينة لطرد المذيب المتبقي. غالبًا ما يمكن للبلورات بالأشعة السينية اكتشاف المذيب داخل البلورة.